Validación in silico de oligonucleótidos-primers para la detección especifica de salmonella spp. mediante reacción en cadena de la polimerasa.

Abstract

Salmonella es un patógeno transmitido por el consumo de alimentos y agua contaminada, de elevada prevalencia. Los métodos convencionales para la detección de esta bacteria patógena requiere procedimientos, que involucran etapas de pre-enriquecimiento, enriquecimiento selectivo e identificación bioquímica, las cuales son sumamente laboriosas, consumen mucho tiempo y poco sensibles. Por tanto, el objetivo de esta investigación fue evaluar la capacidad de los oligonucleótidos-primers 139-R y 141-F propuestos por Rahn et al., (1992) para la detección y amplificación del gen InvA de Salmonella spp. El análisis, verificación y validación in silico de oligonucleótidos a través de algoritmos computacionales y empleando la reacción en cadena de polimerasa in silico, son una alternativa que permite aceptar o rechazar los pares de cebadores potenciales para la PCR sin desperdiciar ningún producto químico, así como el costo relacionado.

Salmonellae are one of the most prevalent water and food borne pathogens. The conventional methods for detection of these pathogenic bacteria involve several rounds of selective enrichment and biochemical identification which are laborious, time consuming, and less sensitive. To evaluate the oligonucleotides computationally 139 -R and 141 -F published by Rahn et al. (1992) for especific detection, identification and amplification for nucleotide sequences within the invA gene of Salmonella spp. In silico analysis, verification and validation of oligonucleotides through computational algorithms and using in silico polymerase chain reaction, they are an alternative that allows to accept or reject potential pairs of PCR primers without wasting any chemical, as well as the related cost

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